一些有機(jī)物和無機(jī)物對生物系統(tǒng)存在抑制性和毒性。這些不利影響通常發(fā)生在工業(yè)廢水處理、垃圾滲濾液處理或者接受大量該類廢水的生活污水處理廠中。

一般來講，一種污染物要么發(fā)生自我抑制（抑制自身的降解），要么對其他物質(zhì)發(fā)生競爭性和非競爭性抑制作用，某種污染物的抑制特性難以通過單一參數(shù)決定，但須進(jìn)行檢測來預(yù)測抑制類型和抑制程度。此外，同一種污染物在不同系統(tǒng)中的抑制作用也不相同。例如，絕大部分有機(jī)物對硝化作用的影響都大于對有機(jī)物去除的影響。

一些特定有機(jī)物超過臨界濃度而微生物無法適應(yīng)時就會對微生物產(chǎn)生毒性或抑制性作用，導(dǎo)致大分子有機(jī)物的去除受到抑制。例如，2-硝基酚在好氧條件下幾乎不降解或降解程度有限，而且會抑制其他有機(jī)物的去除，從而使得COD、BOD3或TOC等綜合指標(biāo)的去除率下降，因此被定義為非生物降解有機(jī)物和抑制性物質(zhì)。

幸運(yùn)的是，絕大部分抑制性和毒性有機(jī)污染物都可以被活性炭吸附。它們的活性炭吸附過程對反應(yīng)器中的懸浮和固著態(tài)微生物都會產(chǎn)生保護(hù)作用。此外，活性炭表面也會發(fā)生生物降解過程，將一些特定毒性有機(jī)污染物轉(zhuǎn)化為無du害物質(zhì)。活性炭的這種有利作用在BAC系統(tǒng)中更加得到強(qiáng)化，因?yàn)槲⑸镌贕AC表面以固著態(tài)的形式存在。

測試某種特定物質(zhì)的抑制作用的方法很多，比耗氧速率（specifie oxygen uptakerate，SOUR）的測試就是一種常用方法.眾所周知，苯酚對生物系統(tǒng)的抑制性很強(qiáng)，因此常被作為檢測活性炭對生物系統(tǒng)影響的典型化合物。例如，投加PAC的活性污泥系統(tǒng)對進(jìn)水苯酚的耐受濃度可達(dá)到1000mg／L。

對生物系統(tǒng)產(chǎn)生不利影響的無機(jī)物中重金屬占了很大比例。一方面，銅、鋅、鎳、鉛、鎘和鉻會與微生物酶反應(yīng)從而阻礙甚至完全抑制新陳代謝；另一方面，重金屬也可以被活性炭吸附。這種吸附作用甚至可以省去生物系統(tǒng)前對重金屬的預(yù)沉淀處理。